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世界首個GPU加速MD程序建立

作者： 2013年07月19日 來源： 瀏覽量：
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近日，中科院過程工程研究所高性能計算與化學信息學課題組建立了世界首個基于單GPU(圖形處理器)加速的化學反應分子動力學（MD）程序GMD-Reax，其單節(jié)點計算能力（相比于8核CPU）比國際先進水平提升數(shù)倍。這將使煤熱

    近日，中科院過程工程研究所高性能計算與化學信息學課題組建立了世界首個基于單GPU(圖形處理器)加速的化學反應分子動力學（MD）程序GMD-Reax，其單節(jié)點計算能力（相比于8核CPU）比國際先進水平提升數(shù)倍。這將使煤熱解等復雜化學反應模擬成為可能。


　　近年來，將專門用于圖像處理的GPU卡應用于分子動力學計算的嘗試成為熱點，但經(jīng)典MD模擬的主要是分子體系的物理過程，不能應用于含化學反應的過程。應用量子力學（化學）方法從分子水平計算化學反應，其單一計算節(jié)點可應用規(guī)模只有數(shù)百個原子；國外科學家提出的化學反應力場ReaxFF與經(jīng)典MD結合可提高到數(shù)千個原子。而如果利用GPU加速ReaxFF MD，則能提高到數(shù)萬個原子甚至更多，從而使一些大規(guī)模體系的復雜化學反應（如煤熱解）的模擬成為可能。

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